Nedaleko od župne crkve sv. Martina biskupa u Ližnjanu na glavnom trgu i lokalitetu »na Muntu« nalazila se stara crkva iz nepoznata vremena. Na njezinu mjestu 1704. podignuta je današnja i posvećena Majci Božjoj od Milosti. Ona se nalazi uz prometnicu, na križanju cesta za Medulin i Šišan. Ulaz i pročelje ograđeni su niskim zidićem i zaštićeni rešetkastim vratima. Plošno pročelje s vratima i dvama bočnim četvrtastim prozorima ispod niskoga 10-metarskoga zvonika ima okrugli okulus zatvoren žičanom rešetkom. Četvrtasta građevina crkve završava sniženom poluokruglom apsidom na kojoj su dva manja prozora s njezine bočne strane. Prozori lučnih završetaka nalaze se i na bočnim zidovima lađe. U unutrašnjosti je svetište odijeljeno trijumfalnim lukom i u njemu je postavljen kameni oltar na kojem se nalazi ostakljena niša s okrunjenim kipovima Blažene Djevice Marije i Djeteta. Ispred oltara drveni je oltarni stol okrenut prema puku. Crkva je obnovljena 1982. i 1999. godine.
Ispred župne crkve 11. studenoga 2015. postavljena je stopa sv. Martina u sklopu Europske mreže kulturnih centara sv. Martina i Kulturnoga centra sv. Martina iz Hrvatske u suradnji sa župom iz Ližnjana.
U Ližnjanu je bilo nekoliko crkava koje su nestale. Nestala je crkva sv. Mihovila na starom groblju, iz koje se zvono iz 1410. godine nalazi u nekom muzeju New Yorka, i crkva sv. Tome apostola na lokalitetu Kuje iz 15. st. Sv. Tomom u 17. st. imenovano je i pristanište, koje je napušteno za vrijeme kuge. Nestale su i srednjovjekovna crkva sv. Antuna opata na istoimenom brježuljku i crkva Majke Božje od Pompinjana na lokalitetu i ugaslom selu Pompinjanu, koje se spominje u darovnici plemićke obitelji Sergijevaca (slavoluk u Puli) opatiji sv. Mihovila u Puli 990. i ispravi iz 1150.
